多肽性质计算器(PeptideCalc)
1. 输入多肽序列:
长度:
支持标准氨基酸和使用花括号表示的特殊氨基酸。
A linear peptide
Calculation Results
SMILES
Physicochemical Properties
| Formula | — |
|---|---|
| Molecular Weight | — |
| LogP | — |
| Isoelectric Point (pI) | — |
| Net Charge at pH 7.4 | — |
| Extinction Coefficient 280nm (Reduced) | — |
| Extinction Coefficient 280nm (Oxidized) | — |
| Extinction Coefficient 205nm | — |
| Extinction Coefficient 214nm | — |
Aggregation Propensity (AggrePep Light)
| Prediction | — |
|---|---|
| Max Score [0, 1] | — |
| Aggregation Regions | — |
pH vs Charge Plot
关于PeptideCalc工具
PeptideCalc是一款综合性的多肽性质计算工具,旨在为研究人员提供快速、准确的多肽理化性质分析。本工具支持的功能包括:
- 常规理化性质计算:支持计算多肽的分子量(Molecular Weight)、等电点(Isoelectric Point, pI)、净电荷(Net Charge at pH 7.4)、消光系数(Extinction Coefficients, 205nm/214nm/280nm)以及亲疏水性(LogP)等关键参数。
- 聚集倾向预测:基于AggrePep Light模型(PALM 服务),预测多肽的聚集倾向。该结果属于模型预测,用于辅助评估多肽的溶解性和稳定性。
- SMILES生成:支持生成多肽的SMILES字符串,方便进行后续的化学信息学分析。
- pH-电荷曲线:生成pH值与净电荷的关系曲线,直观展示多肽在不同pH环境下的带电情况。
理化性质按公开参数表计算;LogP 为理论预测值;聚集倾向为模型预测,均用于辅助判断,不代表实验测定结果。